# TCR 시퀀싱 (TCR sequencing) TCR 시퀀싱은 특정 조직이나 혈액 샘플 내에 존재하는 T 세포들의 [[T세포 수용체 (TCR)]] 유전자 서열을 분석하는 차세대 시퀀싱(Next-Generation Sequencing, NGS) 기술이다. 이를 통해 T 세포 클론의 종류, 빈도, 다양성 등 [[TCR 레퍼토리 (TCR Repertoire)]]의 특징을 정량적으로 파악할 수 있다. ## 원리 1. **샘플 준비:** 혈액(PBMC)이나 조직에서 T 세포의 RNA 또는 DNA를 추출한다. 2. **TCR 유전자 증폭:** [[V(D)J 재조합]]으로 만들어진 TCR의 가변 부위, 특히 항원 특이성을 결정하는 **CDR3(Complementarity-Determining Region 3)** 영역을 포함하도록 PCR(중합효소 연쇄 반응)을 통해 증폭한다. 3. **라이브러리 제작 및 시퀀싱:** 증폭된 DNA 조각에 시퀀싱용 어댑터를 붙여 라이브러리를 만들고, NGS 장비를 이용해 대량으로 염기서열을 분석한다. 4. **데이터 분석:** 얻어진 시퀀싱 데이터를 생물정보학 파이프라인을 통해 분석하여 각 TCR 클론(동일한 CDR3 서열을 가진 T 세포 집단)의 서열과 빈도를 확인하고, 레퍼토리의 다양성 지수 등을 계산한다. ## 활용 분야 - **면역항암제 연구:** [[면역관문억제제 (Immune Checkpoint Inhibitor)]] 치료 전후의 TCR 레퍼토리 변화를 분석하여 치료 반응성을 예측하거나 작용 기전을 연구한다. - **감염 질환:** 특정 바이러스나 세균에 반응하는 T 세포 클론을 식별하고 추적한다. - **자가면역질환:** 질병을 유발하는 특정 T 세포 클론을 찾아내고, 치료에 따른 변화를 모니터링한다. - **백신 개발:** 백신 접종 후 생성되는 항원 특이적 T 세포 반응을 평가한다. - **이식:** 이식 거부 반응과 관련된 T 세포 클론을 모니터링한다. --- **관련 문서:** [[TCR 레퍼토리 (TCR Repertoire)]], [[V(D)J 재조합]], [[면역항암치료]]